엔지켐생명과학, 감사의견 거절로 거래정지·상장폐지 위기 속 주주소송

엔지켐생명과학은 2021년 11월 인도 제약사 자이더스카딜라와 코로나19 백신 위탁생산(CMO) 계약을 체결하며 신성장동력 확보를 기대했다. 그러나 자이더스카딜라가 개발한 백신 자이코브디(Zycov-D)가 미국·유럽 등 주요국에서 허가를 받는 데 실패하면서 관련 사업은 결국 실현되지 못했다. 이 사업 무산은 이후 회사의 매출 감소와 연구소 축소 등 조직 슬림화로 이어지는 계기가 됐다. 재무구조가 악화되는 가운데 회사는 신규 자금 조달을 위한 대여·투자성 거래를 늘려나간 것으로 전해졌다. 이러한 배경은 훗날 감사범위 제한에 따른 의견거절 사태의 원인 중 하나로 지목된다.

엔지켐생명과학은 2026년 3월 23일 외부감사인으로부터 '감사범위제한으로 인한 의견거절'을 받았다고 공시했다. 이는 코스닥시장 상장규정에 따른 상장폐지 사유에 해당해 한국거래소는 즉시 해당 종목의 매매거래를 정지시켰다. 거래정지는 이날 16시 7분부터 상장폐지에 대한 이의신청 기간 만료일 또는 상장폐지 여부 결정일까지 이어지는 것으로 공지됐다. 감사의견 거절의 배경에는 특정 대여 거래와 관련해 자금 이동 후 자사주 취득이나 비상장 투자로 이어진 정황의 실질성을 입증할 자료가 부족했다는 점이 꼽혔다. 이 조치로 소액주주들은 갑작스러운 거래정지에 큰 충격을 받았다.

엔지켐생명과학은 거래정지 통보로부터 20여일 뒤인 2026년 4월 10일 한국거래소에 상장폐지 관련 이의신청서를 제출했다. 첫 번째로 상장폐지 사유가 발생한 기업으로서 회사는 1년 뒤인 2027년 4월 10일까지 재무구조와 내부통제를 개선할 수 있는 유예 기간을 부여받았다. 2년 연속으로 상장폐지 사유가 발생하는 기업은 그해 중 한국거래소 기업심사위원회 심의를 거쳐 상장폐지 여부가 최종 판가름 나지만, 엔지켐은 아직 첫 해당 기업이라 개선기간이 종료된 이후에야 기업심사위 심의를 받게 될 예정이다. 회사는 개선기간 동안 부동산 신사업 추진과 대표집행임원제 도입 등을 통한 지배구조 재정비를 예고했다. 이 시기 코스닥 시장에서는 42개 상장사가 유사한 상장폐지 사유로 무더기 위기에 놓여 있어 업계 전반의 관심이 집중됐다.

소액주주 A씨는 2026년 6월 18일 서울중앙지방법원에 회사와 경영진 4인을 상대로 임시주주지위확인가처분을 신청했다. 보통주 485만7465주에 대해 주주 지위를 임시로 인정해 달라는 취지로, 청구액은 약 23억5000만원에 달했다. 회사 측은 즉각 "주주명부 명의개서 및 전자등록 등 적법한 절차를 통해 신청인에게 주식이 귀속되거나 주주권이 확인된 사실이 없다"며 강하게 반발했다. 이 가처분 신청은 거래정지로 촉발된 경영권 및 지배구조를 둘러싼 갈등이 본격적인 법적 다툼으로 번지는 계기가 됐다. 심문기일은 이후 7월 초로 지정됐다.

서울중앙지방법원 제50민사부는 2026년 7월 6일 A씨가 제기한 임시주주지위확인가처분 사건의 심문기일을 열었다. 이 자리에서 신청인 측은 주식 귀속의 근거를, 회사 측은 적법한 명의개서 절차가 없었다는 반박 논리를 각각 주장한 것으로 전해졌다. 같은 시기 회사를 상대로는 임시주주총회 개최금지 가처분도 함께 제기돼 두 사건이 병행 심리됐다. 회사는 개선기간 중 예정된 임시주주총회를 통해 이사·감사 선임과 지배구조 재정비를 추진하려던 계획이 이 가처분들로 인해 차질을 빚을 위기에 놓였다. 법원의 결정은 예정된 임시주총 개최 여부에 직접적인 영향을 미치는 중대 변수로 주목받았다.

서울중앙지방법원은 2026년 7월 23일 A씨 등이 제기한 임시주주지위확인가처분과 임시주주총회 개최금지가처분을 모두 기각했다. 이로써 회사는 예정대로 임시주주총회를 개최할 수 있게 됐으며, 회사 측은 법원과 주주 모두 현 경영진의 손을 들어줬다고 자평했다. 이 결정으로 개선기간 중 추진해온 지배구조 재정비와 거래재개 준비 작업에도 속도가 붙게 됐다. 회사는 가처분 기각을 근거로 소액주주 일각의 문제 제기가 근거 없는 것이었다고 주장했다. 다만 신청인 측이 항고 등 추가 법적 대응에 나설 가능성은 남아 있는 상태였다.

가처분 기각 결정이 나온 당일인 2026년 7월 23일 오후 엔지켐생명과학은 임시주주총회를 열어 이사 및 감사 선임, 정관 변경, 이사회와 감사기구 재정비, 내부통제 체계 보강 등의 안건을 상정했다. 표결 결과 모든 안건이 발행주식총수의 약 52%, 출석 주주의 80% 이상 찬성으로 원안대로 가결됐다. 다만 소액주주연대 측은 새로 선임되는 사내이사 후보 상당수가 토지개발·산업단지·건설 분야 경력을 보유해 바이오기업의 전문성과 맞지 않는다는 문제를 제기했다. 신사업으로 거론된 부동산 개발 진출 방침에 대해서도 본업과의 연관성에 의문이 제기됐다. 회사 측은 거래재개와 재무구조 개선을 위한 불가피한 조치라는 입장을 밝혔다.

임시주총 직후 회사는 "외부 세력의 배후에 과거 자본시장법 위반, 횡령·배임, 무자본 M&A, 주가조작 등 불법행위 전력이 있는 인물들이 개입한 정황"을 포착했다고 주장하며 민·형사상 법적 대응을 검토 중이라고 밝혔다. 다만 이는 회사 측의 일방적 주장으로, 구체적 인물이나 근거가 공개되거나 수사기관을 통해 확인된 바는 없다. 소액주주 진영에서는 이러한 주장이 정당한 문제 제기를 위축시키려는 것이라며 강하게 반발했다. 가처분 기각과 임시주총 안건 가결로 자신감을 얻은 경영진이 반대 측에 대한 압박 수위를 높인 것이라는 해석도 나왔다. 회사는 2027년 4월로 예정된 개선기간 만료 전까지 거래재개 요건 충족에 총력을 기울이겠다는 방침이다.